申请人可以登陆“中华人民共和国海关总署门户网站” —“在线服务”—“办事指南”—“海关系统行政审批事项指南”—“口岸卫生许可证核发”栏目查阅国境口岸卫生许可证办理指南。按照指南要求下载并且填写《国境口岸卫生许可证申请书》并提供指南要求的有关证明材料。申请国境口岸卫生许可的申请人可以在海关公共服务平台（http://online.customs.gov.cn/）注册并提交申请资料。海关应当自受理申请之日起13个工作日内作出行政许可决定（现场审查和整改时间不计在内）。因特殊原因需要延长许可期限的，经本机构负责人批准，可以延长10个工作日，并应当将延长期限的理由告知申请人。对准予行政许可决定的，检验检疫部门应当自作出决定之日起10个工作日内向申请人颁发卫生许可证。