保税区注册公司的好处具体包括以下几点：

先来讲下注册在自贸区保税区的优势：

1，出口退税，出口方便

2，进口海关关税部分商品下调及豁免

3，进口产品可以仓储在自贸区内，如果暂时不提货的话是不交关税、增值税，提货的时候再计税。那这部分资金就是用作企业流动资金运转。

4，通关速度

5，跨境商务通过网上平台注册

6、出口退税速度快、无需实地注册简单地说保税区比区外有很大的优势便利性。

7，转口贸易免征增值税转口贸易又称中转贸易或再输出贸易，是指国际贸易中进出口货品的生意，不是在生产国与消费国之间直接进行，而是通过第三国易手进行的买卖。这种贸易对中转国来说即是转口贸易。

8，外汇金额留存，不需要名目，人民币外币自由兑换方便无限制，也可直接用作海外投资。